De behandeling begint bij de ogen, daarna het voorhoofd, de hypofyse, de oren, de keel, schildklieren, borstkas met thymus en hart, maag, galblaas, lever, pancreas, zonnevlecht, dunne en dikke darm, eileiders en de blaas. Daarna draaien op de buik (indien mogelijk) en behandeling op de rug van de longen, sympatische zenuwen, nieren, milt en de prostaat.

Iedereen reageer anders op een Reiki-behandeling. De meest voorkomende ervaring bij een behandeling is rust en ontspanning, vaak samengaand met een gevoel van geborgenheid, omhuld door een fijne, prettige energie. Maar ook dat is geen regel.
Als we iemand met Reiki behandelen, leggen we onze handen licht en rustig op de verschillende zones van het lichaam van de ontvanger. Vaak voelen we al heel snel een soort stromen, een gevoel van warmte dat soms wel tot gloeien kan toenemen, in sommige gevallen ook koelheid of kou. Beiden worden vaak zowel door de ontvanger als door de behandelaar even duidelijk gevoeld. Het gebeurt ook dat de ontvanger in slaap valt. Dit heeft geen enkele invloed op de werking.
Ook kunnen oude onverwerkte belevenissen naar boven komen en emoties losmaken in de vorm van een bevrijdende lach of een traan. Deze reactie zijn van korte duur en zijn een teken dat er genezing plaats vindt. Erna voelt de ontvanger zich in de regel aanmerkelijk beter dan te voren.

Reiki kan gebruikt worden bij jong en oud, alle ziektebeelden die zich manifesteren aan het hoofd, keel, ademhaling, hart-bloedsomloop, spijsvertering, uitscheiding (lever, gal, nieren, milt, alvleesklier, blaas en darmen), seksueel en genitaal gebied, huid, bewegingsapparaat, infecties, allergiën, kinderziekten, kanker, psyche.
De werking van Reiki blijft niet beperkt tot het lichamelijke niveau. Ze breidt zich uit over het totale lichaam, zowel lichamelijk, geestelijk,het emotionele deel en de ziel van de mens. Het ene kan nou eenmaal niet zonder het andere. Reiki bevorderd het zelfgenezend vermogen.
Natuurlijk hoef je niet ziek te zijn om een behandeling te mogen ontvangen. Het is heel prettig om af en toe eens diep te ontspannen, en zelfs preventief met je gezondheid bezig te zijn.  

Binnen vier dagen tot drie weken ervaren we een grote verandering in het lichaam. Alle innerlijke organen en klieren beginnen veel sterker en regelmatiger te werken. De spijsvertering werkt soepeler, de geblokkeerde zenuwen ontspannen zich. Knelpunten verdwijnen en een luie dikke darm herstelt zich.
Ontlasting laat los van de ingewanden en gassen verdwijnen door de poriën, in de vorm van kleverig zweet. De ontlasting wordt donkerder en sterker van geur. Urine wordt soms als donker thee, soms wit als meel vermengd met water. Het duurt vier tot zes dagen, soms ook bij patiënten die slecht een enkele behandeling hebben gehad.

Wanneer dit alles blijkt, kun je verzekerd zijn dat er een grote beurt gegeven is aan alle inwendige organen. Na zo'n schoonmaak wordt het lichaam aktief. De afgestompte zenuwen worden gevoeliger, men krijgt meer trek, slaapt gezonder, de ogen staan helder en de huid voelt als zijde aan.

Om de Reiki (iedere) behandeling te ondersteunen en het genezingsproces te versnellen, is het belangrijk goed te eten met dankbaarheid en in een prettige sfeer.